Αρμόδια όργανα για την οργάνωση και λειτουργία του Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών «Βιώσιμη Ανάπτυξη» είναι:
α) H Σύγκλητος Ειδικής Σύνθεσης (Σ.Ε.Σ.) του Ιδρύματος, η οποία είναι αρμόδια για κάθε θέμα διοικητικού ή οργανωτικού χαρακτήρα που σχετίζεται με τις μεταπτυχιακές σπουδές.
β) Η Γενική Συνέλευση Ειδικής Σύνθεσης (Γ.Σ.Ε.Σ.) του Τμήματος, έχει την ευθύνη της εξειδίκευσης της πολιτικής του Τμήματος σε ό,τι αφορά την έρευνα και τις μεταπτυχιακές σπουδές. Επίσης, η Γ.Σ.Ε.Σ. είναι αρμόδια για κάθε θέμα διοικητικού ή οργανωτικού χαρακτήρα που σχετίζεται με τις μεταπτυχιακές σπουδές σε επίπεδο Τμήματος και για την κατάρτιση ή την τροποποίηση του Προγράμματος μαθημάτων του Μεταπτυχιακού Διπλώματος Ειδίκευσης του ΠΜΣ.
γ) Η Συντονιστική Επιτροπή (Σ.Ε.) του ΠΜΣ είναι αρμόδια για την παρακολούθηση, την εποπτεία και το συντονισμό του συνόλου των μεταπτυχιακών δραστηριοτήτων του ΠΜΣ. Η Σ.Ε. απαρτίζεται από τρία τουλάχιστον μέλη ΔΕΠ του Τμήματος, τα οποία έχουν αναλάβει μεταπτυχιακό διδακτικό έργο.
δ) Ο Διευθυντής Μεταπτυχιακών Σπουδών του ΠΜΣ έχει την ευθύνη της διοικητικής, οργανωτικής και λειτουργικής διεύθυνσης του ΠΜΣ. Ο Διευθυντής εισηγείται τόσο στη Σ.Ε. όσο και απευθείας στη Γ.Σ.Ε.Σ. του Τμήματος για κάθε θέμα που αφορά την αποτελεσματική λειτουργία και την ποιοτική βελτίωση του ΠΜΣ.